Столкнулся с проблемой, что не могу штатными средствами сжать диск ubuntu server, форматированный в ext4 в VMWare

Решение оказалось простое. В гостевой ОС надо было выполнить следующее: 

cd /usr/bin

sudo ./vmware-toolbox-cmd disk list

например, выйдет:

/

/boot

следующая команда:

sudo ./vmware-toolbox-cmd disk shrink /